生物制品下游层析系统中的空调系统停机可能会对层析介质产生一些影响，具体影响取决于多种因素，包括停机的时间长短、温度波动以及层析介质的性质。以下是一些可能的影响：

层析介质的稳定性：层析介质可能对温度敏感，长时间的停机和温度波动可能导致介质的降解或不稳定性增加，从而影响层析分离的质量和性能。

层析柱的影响：停机后，层析柱内的样品可能会逐渐干燥，这可能导致柱内物质的沉积，特别是在柱底部。这可能会影响后续分离的均匀性和分离效率。

温度影响：停机期间环境温度的波动可能导致介质的温度变化，从而影响分离过程的温度控制。温度变化可能会引起柱内压力的波动，进一步影响分离效果。

样品保存：如果停机时间较长，样品也可能受到温度波动的影响，从而导致样品的降解或变性。

为减小这些影响，建议在停机期间采取以下措施：

监测环境温度：尽量保持系统内的温度稳定，以减小层析介质的温度波动。

考虑介质稳定性：选择稳定性较好的层析介质，以降低介质在停机期间的降解风险。

定期维护：确保定期维护和检查空调系统，以减小突发停机的风险。

样品保存：如果停机时间较长，考虑将样品存储在适当的温度下，以减小样品的降解风险