首先要区分你的原料、辅料和制剂的主要成分，是否在法规规定不能共线的范围内、如激素、青霉素等。如果不在法规规定的高毒高活范围内，可以往清洁验证方向走，毕竟大家都不愿意购买的原料、辅料有其他的残留导致异常。

清洁验证考虑思路先区分共线的设备、厂房等，按照清洁验证的思路确定共线设备厂房后确认限度并进行清洗方法的研究，包括冻干机在内都需要进行。

此外，厂房需要进行清洁，避免污染和交叉污染。

根据CFDI发布的《药品共线生产质量风险管理指南》共线评估内容：

共线生产风险评估应当综合考虑药品的特性、工艺流程和预定用途等因素。技术转移阶段的相关试验和研究结果可作为共线生产风险评估的一部分。应当结合技术转移接受方的硬件及软件条件，确定厂房、生产设施和设备多产品共线的可行性，并有相应的风险评估报告。对于拟共线生产的产品进行风险评估时应当根据共线产品的具体情况进行分析，可参照但不限于以下方面进行风险识别和分析：

（1）拟共线生产品种的特性，如：

• 产品类别（如化学药品、中药制剂、生物制品、药用辅料等）

• 活性、毒性（如是否具有细胞毒性、治疗窗窄、基因毒性、致癌性等，PDE/ADE 值、职业接触限值（OEL）、毒理学关注阈值（Threshold of Toxicological Concern，TTC）等）

• 致敏性

• 溶解度

• 活性微生物

• 性状（如：颜色、气味、粘度等）

• 物质状态（如：固态、液态等）

• 挥发条件

• 稳定性

（2）共线生产品种的工艺

• 最终灭菌或无菌生产工艺

• 采用生物工艺进行生产（生物安全性风险）

• 生产过程中所用物料的特性（如溶媒特性、生物安全性）

• 其他

（3）共线生产品种的预定用途

• 给药途径（如口服、外用、肌肉注射、静脉注射、鞘膜内注射等）

• 临床适应症

• 用药禁忌、配伍禁忌或联合用药

• 用药对象（如老年人、孕妇、儿童）

• 用药剂量

• 长期用药（药品在体内是否蓄积并产生毒性）

（4）拟共线品种的厂房、设施共用情况

• 厂房、空调系统

• 设备种类、材质

• 清洁难易程度、清洁方法与清洁验证

• 设备控制方式及生产能力

• 暴露情况，包括识别暴露的潜在途径和来源等

生产某些激素类、细胞毒性类、高活性化学药品应当使用专用设施（如独立的空气净化系统）和设备；特殊情况下，如采取特别防护措施并经过必要的验证，上述药品制剂则可通过阶段性生产方式共用同一生产设施和设备。持有人或药品生产企业进行风险评估的范围、正式程度和文件化水平应当与风险级别相适应

根据上述描述，我的理解就是，这种情况下原辅料和制剂成品是可以共线的，药品生产阶段应当针对共线生产产品间的污染和交叉污染途径制定可行的控制措施，不定期对控制措施的执行情况进行检查，以确保持续有效地执行控制措施。即清洁验证做合理，并定期进行回顾。

在原料、辅料和制剂均需要进行冻干工艺，且在同一个车间中进行共线生产的情况下，确保冻干设备和管路的共线是可行的，但需要特别关注以下控制措施，以确保产品的质量和安全：

设备清洁和消毒：在原料、辅料和制剂之间进行共线生产前，确保冻干设备和管路彻底清洁和消毒。这有助于防止交叉污染和交叉污染。

设备分隔：尽量将不同原料、辅料和制剂的工作区域分隔开来，以减少风险。这可以通过物理隔离、工作区域的标记和严格的工作程序来实现。

清洁验证：确保设备清洁和消毒的有效性，通过进行清洁验证来验证。这可包括使用适当的检测方法来确认设备是否已彻底清洁。

批记录和标签：在批记录中明确记录不同产品的生产和设备清洁步骤。此外，使用明确的标签和标识来标记容器、设备和管路，以确保不发生混淆。

人员培训：确保工作人员经过充分培训，了解工艺控制措施、清洁程序和产品标识。他们应该明白如何防止混淆不同原料、辅料和制剂。

监测和采样：进行定期监测和采样以确保产品质量。这包括监测过程参数，如冻干周期、温度和压力，以及产品的最终质量属性。

风险评估：进行风险评估，识别共线生产可能带来的风险，并采取适当的控制措施来降低这些风险。

变更控制：任何关于原料、辅料、制剂或工艺的变更都应该经过适当的变更控制程序，以确保变更不会对产品质量产生负面影响。

以上控制措施有助于确保在同一个车间中进行原料、辅料和制剂的共线冻干工艺生产时，不会发生交叉污染或混淆。同时，遵守相关法规和标准也是至关重要的，以确保产品符合质量和安全要求。